Molecular Design
Computergestützte Wirkstoffentwicklung
Beschreibung
Dieses Projekt verfolgt die Entwicklung von Molekülen mit spezifischen Eigenschaften. Dafür werden Methoden entwickelt, die es ermöglichen, große molekulare Systeme wie Rezeptor-Ligand-Komplexe zu simulieren. Der Schwerpunkt liegt auf der Simulation der Bindungsprozesse und Abschätzung der Bindungsaffinitäten. Unsere Highlights sind die Methode zur Rekonstruktion des Bindungspfades des Liganden in den Rezeptor und Simulation innerhalb der Bindungstasche. Wir haben bewiesen, dass conformation dynamics zusammen mit PCCA+ die Konstruktion eines neuen generalisierten Generators zur Simulation der molekularen Kinetik erlaubt, welcher die Berechnung der Übergangsratenmatrix ohne Anwendung der molekularen Dynamik ermöglicht. Unsere aktuellen Anwendungen sind Entwicklung der Schmerzmittel mit eingeschränktem Wirkungsbereich und Prüfung der Giftigkeit der Flammschutzmittel.
Weitere Informationen finden sich in der ausführlichen Projektbeschreibung.
Mitarbeiter
Peter Deuflhard
Alexander Bujotzek
Konstantin Fackeldey
Karsten Andrae
Olga Scharkoi
Vedat Durmaz
Ole Schütt
Martina Klimm
Verantwortlich
Partner
Christoph Stein (Charité Berlin)
Roland Becker (BAM: Federal Institute for Materials Research and Testing)
Jörg Rademann (FMP: Leibniz-Institute for Molecular Pharmocology)
Hua Fan (Charité Berlin)
Finanzierung
DFG Research Center MATHEON "Mathematics for key technologies",
Research Project A4 BAM Bundesanstalt für Materialforschung
Dauer
07/2006 -