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KONRAD-ZUSE-ZENTRUM
FÜR INFORMATIONSTECHNIK
BERLIN

Conformation Dynamics

Gitterfreie Methoden in der Konformationsdynamik

Beschreibung

 

In diesem Projekt werden gitterfreie Methoden für Anwendungen in der Konformationsdynamik entwickelt, erweitert, und in ZIBgridfree implementiert. Momentane Schwerpunkte dieser Entwicklung sind die adaptive hierarchische Verfeinerung von Ansatzfunktionen während des Samplings sowie Methoden zur statistischen Fehlerschätzung. ZIBgridfree bietet nun eine offene Schnittstelle zu verschiedenen Kraftfeldern, beliebig definierbare Typen von internen Koordinaten and diverse andere Erweiterungen, die den Modellierungsprozess und die Trajektorienanalyse verbessern.

Weitere Informationen finden sich in der ausführlichen Projektbeschreibung.

Mitarbeiter

  Marcus Weber
Peter Deuflhard
Konstantin Fackeldey
Susanna Röblitz
Alexander Bujotzek

Verantwortlich

  Peter Deuflhard
Marcus Weber

Partner

 
  • Monika Schäfer-Korting (FU Berlin, Pharmacology and Toxicology)
  • Klaus D. Kramer (FU Berlin, Medical Physics)

Dauer

  07/2006 -