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KONRAD-ZUSE-ZENTRUM
FÜR INFORMATIONSTECHNIK
BERLIN

Reduced Models

Automatische Modellbildung und schnelle Informationsextraktion für die Molekulardynamik

Beschreibung

Die Datenmenge, die weltweit durch Molekulardynamiksimulationen produziert wird, steigt exponentiell an. Methoden, um diese Daten zu interpretieren und zueinander in Beziehung zu setzen, sind jedoch meist nur Experten zugänglich und entwickeln sich wesentlich langsamer. Eine vielversprechende Idee ist es, die Verwaltung der Daten, ihre Strukturierung sowie ihre gegenseitigen Beziehungen, mit Hilfe reduzierter Modelle zu konstruieren, die essentielle Dynamik und geometrische Charakteristiken der betrachteten Systeme beschreiben. In diesem Projekt soll mit der Entwicklung einer ersten Softwareplattform begonnen werden, die auf einer verallgemeinerten Datenbank von molekulardynamischen Zeitreihen basiert und fortgeschrittene interaktive Techniken für statistische und Zeitreihenanalyse sowie Visualisierung bietet. Weitere Informationen finden sich in der ausführlichen Projektbeschreibung.

Mitarbeiter

Johannes Schmidt-Ehrenberg

Verantwortlich

Partner

Arbeitsgruppe Biocomputing, Fachbereich Mathematik, Freie Universität Berlin (Christof Schütte, Illia Horenko, Evelyn Dittmer, Eike Meerbach)

Finanzierung

Microsoft Research Ltd., Cambridge, UK (MSRC Contract No. 2005-042)