Beschreibung

Ziel dieses Projektes ist es, Algorithmen und Module für Amira zu entwickeln, so dass Aktinfilamente und Zellmembranen automatisch von Wissenschaftlern des MPI aus Kryoelektronentomogramme rekonstruiert werden können. Hierbei werden Verfahren entwickelt, die die topologische sowie auch die geometrische Struktur der zu Grunde liegenden Bilddaten ausnutzen. Ziel ist eine zuverlässige, vollständige und reproduzierbare Rekonstruktion der Filamente und Zellmembranen, die mit weniger Benutzeraufwand als die bisherigen manuellen Verfahren verbunden ist. Neben den Bildanalysewerkzeugen werden auch Auswertungs- und Verifizierungsmodule bereitgestellt, die es den Wissenschaftlern erlauben, biologische Vorgänge nachzuvollziehen und zu bestätigen. Weitere Informationen finden sich in der ausführlichen Projektbeschreibung.

Mitarbeiter

David Günther
Daniel Baum
Christian Hege
Steffen Prohaska

Verantwortlich

Steffen Prohaska

Partner

Max-Planck-Institut für Biochemie, Abteilung Molekulare Strukturbiologie (Wolfgang Baumeister, Reiner Hegerl, Alexander Rigort)
Universität Saarland, Mathematische Bildverarbeitung (Joachim Weikert)

Finanzierung

Max-Planck-Institute for Biochemistry, Dept. of Molecular Structural Biology

Dauer

01/2008–12/2010