Microtubules

Segmentierung von Mikrotubuli aus Elekronentomogrammen

Beschreibung

Mikrotubuli sind zylinderförmige Polymere in Zellen die einen Teil des Cytoskelets der Zelle ausmachen. Sie stabilisieren die Zelle, spielen aber auch eine wichtige Rolle bei der Zellteilung. Insbesondere die Spindel - die Struktur die von den Mikrotubuli während der Zellteilung gebildet wird - ist Gegenstand der aktuellen Forschung. Eine der wichtigsten Techniken, die Verteilung der Mikrotubuli in Zellen zu untersuchen, ist die Elektronentomographie. Dabei werden 300nm dicke Sektionen einer Zelle zunächst für die Elektronenmikroskopie präpariert und anschließend mit einer CCD-Kamera aufgenommen. Durch eine inverse Radon-Transformation wird anschließend das Volumen rekonstruiert. Der aufwendigste Teil bei der Untersuchung der Mikrotubuli ist die darauf folgende Erstellung eines exakten Models in den Tomogrammen. Ziel dieses Projektes ist, diesen Prozess durch entsprechende Bildverarbeitungs- und Segmentierungsalgorithmen signifikant zu beschleunigen. Weitere Informationen finden sich in der ausführlichen Projektbeschreibung.

Mitarbeiter

Britta Weber
Daniel Baum
Marit Möller (–10/2012)
Steffen Prohaska
Hans-Christian Hege 

Verantwortlich

Hans-Christian Hege
Steffen Prohaska 

Partner

Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Microtubules and cell division, Hyman Lab, Dresden (Anthony Hyman, Jean-Marc Verbavatz)
TU Dresden, Structural Cell Biology (Thomas Müller-Reichert)
European Molecular Biology Laboratory, Cell Biology and Biophysics, Heidelberg (Erin Tranfield)
Boulder Laboratory for 3D Electron Microscopy of Cells (Eileen O'Toole, David Mastronarde, Richard McIntosh)

Finanzierung

Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (01/2009–06/2012)

Dauer

01/2009–

Publikationen

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